Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAMD4BQ5PRF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD4BQ5PRF9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAMD4BQ5PRF9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAMD4BQ5PRF9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMD4BQ5PRF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAMD4BQ5PRF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAMD4BQ5PRF9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAMD4BQ5PRF9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183 ms