Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2NLQ5JXB2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2NLQ5JXB2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE2NLQ5JXB2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2NLQ5JXB2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms