Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FRMPD3Q5JV73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD3Q5JV73 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FRMPD3Q5JV73 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FRMPD3Q5JV73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FRMPD3Q5JV73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms