Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf38Q5JPI3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf38Q5JPI3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf38Q5JPI3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf38Q5JPI3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf38Q5JPI3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms