Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gcnt3Q5JCT0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcnt3Q5JCT0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcnt3Q5JCT0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcnt3Q5JCT0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcnt3Q5JCT0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gcnt3Q5JCT0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gcnt3Q5JCT0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt3Q5JCT0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt3Q5JCT0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt3Q5JCT0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt3Q5JCT0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gcnt3Q5JCT0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms