Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFAIP8L3Q5GJ75 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFAIP8L3Q5GJ75 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms