Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grhl3Q5FWH3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grhl3Q5FWH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grhl3Q5FWH3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grhl3Q5FWH3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grhl3Q5FWH3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grhl3Q5FWH3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grhl3Q5FWH3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grhl3Q5FWH3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grhl3Q5FWH3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grhl3Q5FWH3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grhl3Q5FWH3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms