Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM61Q5EBN2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM61Q5EBN2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM61Q5EBN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM61Q5EBN2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM61Q5EBN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM61Q5EBN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms