Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KHDC3LQ587J8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KHDC3LQ587J8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KHDC3LQ587J8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KHDC3LQ587J8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms