Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PYDC2Q56P42 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PYDC2Q56P42 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC2Q56P42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PYDC2Q56P42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PYDC2Q56P42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms