Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF1BQ53T94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF1BQ53T94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TAF1BQ53T94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TAF1BQ53T94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TAF1BQ53T94 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF1BQ53T94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms