Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSM3Q53FZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSM3Q53FZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSM3Q53FZ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSM3Q53FZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms