Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC2HC1CQ53FD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC2HC1CQ53FD0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZC2HC1CQ53FD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZC2HC1CQ53FD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZC2HC1CQ53FD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZC2HC1CQ53FD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC2HC1CQ53FD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms