Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCD4Q53EL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDCD4Q53EL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDCD4Q53EL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDCD4Q53EL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms