Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARHGAP29Q52LW3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGAP29Q52LW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGAP29Q52LW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARHGAP29Q52LW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARHGAP29Q52LW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms