Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc47Q505F5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc47Q505F5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc47Q505F5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc47Q505F5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc47Q505F5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc47Q505F5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc47Q505F5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc47Q505F5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc47Q505F5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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