Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FNDC1Q4ZHG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FNDC1Q4ZHG4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FNDC1Q4ZHG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.2 ms