Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Srek1ip1Q4V9W2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Srek1ip1Q4V9W2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srek1ip1Q4V9W2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srek1ip1Q4V9W2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srek1ip1Q4V9W2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms