Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FBXO43Q4G163 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO43Q4G163 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO43Q4G163 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FBXO43Q4G163 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FBXO43Q4G163 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FBXO43Q4G163 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms