Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDNFQ49AH0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDNFQ49AH0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDNFQ49AH0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDNFQ49AH0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDNFQ49AH0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms