Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM176BQ3YBM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM176BQ3YBM2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM176BQ3YBM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM176BQ3YBM2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM176BQ3YBM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM176BQ3YBM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM176BQ3YBM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM176BQ3YBM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM176BQ3YBM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms