Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BC030870Q3V2G4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BC030870Q3V2G4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BC030870Q3V2G4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BC030870Q3V2G4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BC030870Q3V2G4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BC030870Q3V2G4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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