Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp48Q3V0C5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp48Q3V0C5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp48Q3V0C5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp48Q3V0C5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp48Q3V0C5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp48Q3V0C5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp48Q3V0C5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms