Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim80Q3V061 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim80Q3V061 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim80Q3V061 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim80Q3V061 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim80Q3V061 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim80Q3V061 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim80Q3V061 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms