Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hipk4Q3V016 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hipk4Q3V016 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hipk4Q3V016 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hipk4Q3V016 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hipk4Q3V016 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.8 ms