Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm6Q3UZD5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm6Q3UZD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm6Q3UZD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prdm6Q3UZD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prdm6Q3UZD5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms