Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clpsl2Q3UW21 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clpsl2Q3UW21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clpsl2Q3UW21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clpsl2Q3UW21 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clpsl2Q3UW21 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clpsl2Q3UW21 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clpsl2Q3UW21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms