Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
D130052B06RikQ3UW13 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D130052B06RikQ3UW13 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
D130052B06RikQ3UW13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
D130052B06RikQ3UW13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms