Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa5b2Q3UR50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa5b2Q3UR50 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa5b2Q3UR50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa5b2Q3UR50 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vwa5b2Q3UR50 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vwa5b2Q3UR50 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms