Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch2Q3UMG5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch2Q3UMG5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch2Q3UMG5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrch2Q3UMG5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrch2Q3UMG5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrch2Q3UMG5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrch2Q3UMG5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrch2Q3UMG5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrch2Q3UMG5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrch2Q3UMG5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms