Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pin1rt1Q3ULQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pin1rt1Q3ULQ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pin1rt1Q3ULQ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pin1rt1Q3ULQ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pin1rt1Q3ULQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms