Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sf3b2Q3UJB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sf3b2Q3UJB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sf3b2Q3UJB0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sf3b2Q3UJB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sf3b2Q3UJB0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sf3b2Q3UJB0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sf3b2Q3UJB0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sf3b2Q3UJB0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Sf3b2Q3UJB0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sf3b2Q3UJB0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sf3b2Q3UJB0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms