Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccser2Q3UHI0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser2Q3UHI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser2Q3UHI0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccser2Q3UHI0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccser2Q3UHI0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccser2Q3UHI0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccser2Q3UHI0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccser2Q3UHI0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccser2Q3UHI0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccser2Q3UHI0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms