Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Yipf3Q3UDR8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Yipf3Q3UDR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Yipf3Q3UDR8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Yipf3Q3UDR8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Yipf3Q3UDR8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms