Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gtpbp6Q3U6U5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtpbp6Q3U6U5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gtpbp6Q3U6U5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtpbp6Q3U6U5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtpbp6Q3U6U5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms