Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYE7

Tmem136, Transmembrane protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem136Q3TYE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem136Q3TYE7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem136Q3TYE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem136Q3TYE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem136Q3TYE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem136Q3TYE7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem136Q3TYE7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem136Q3TYE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem136Q3TYE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms