Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc28Q3TX51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc28Q3TX51 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc28Q3TX51 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc28Q3TX51 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc28Q3TX51 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc28Q3TX51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms