Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pip4p1Q3TWL2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pip4p1Q3TWL2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pip4p1Q3TWL2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pip4p1Q3TWL2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pip4p1Q3TWL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pip4p1Q3TWL2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pip4p1Q3TWL2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pip4p1Q3TWL2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pip4p1Q3TWL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pip4p1Q3TWL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pip4p1Q3TWL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4p1Q3TWL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pip4p1Q3TWL2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms