Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt2Q3TTY5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt2Q3TTY5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt2Q3TTY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt2Q3TTY5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt2Q3TTY5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt2Q3TTY5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt2Q3TTY5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms