Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam107bQ3TGF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam107bQ3TGF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam107bQ3TGF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fam107bQ3TGF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam107bQ3TGF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam107bQ3TGF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam107bQ3TGF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms