Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM30BQ3MIR4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TMEM30BQ3MIR4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM30BQ3MIR4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM30BQ3MIR4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms