Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MYLK3Q32MK0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MYLK3Q32MK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYLK3Q32MK0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYLK3Q32MK0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYLK3Q32MK0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYLK3Q32MK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms