Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KncnQ307W7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KncnQ307W7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KncnQ307W7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KncnQ307W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KncnQ307W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms