Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL38Q2WGJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL38Q2WGJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHL38Q2WGJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHL38Q2WGJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL38Q2WGJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL38Q2WGJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms