Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
C15orf59Q2T9L4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C15orf59Q2T9L4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C15orf59Q2T9L4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C15orf59Q2T9L4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
C15orf59Q2T9L4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf59Q2T9L4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf59Q2T9L4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms