Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TYSND1Q2T9J0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TYSND1Q2T9J0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TYSND1Q2T9J0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TYSND1Q2T9J0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TYSND1Q2T9J0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms