Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL51

Gsk3a, Glycogen synthase kinase-3 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsk3aQ2NL51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gsk3aQ2NL51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsk3aQ2NL51 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gsk3aQ2NL51 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gsk3aQ2NL51 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gsk3aQ2NL51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gsk3aQ2NL51 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms