Protein–RNA interactions for Protein: Q2LA85

Treml2, Trem-like transcript 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml2Q2LA85 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Treml2Q2LA85 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Treml2Q2LA85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml2Q2LA85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Treml2Q2LA85 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Treml2Q2LA85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Treml2Q2LA85 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Treml2Q2LA85 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms