Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CSPP1Q1MSJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CSPP1Q1MSJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSPP1Q1MSJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CSPP1Q1MSJ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CSPP1Q1MSJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms