Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC142Q17RM4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC142Q17RM4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC142Q17RM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC142Q17RM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC142Q17RM4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC142Q17RM4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms